Der Beirat begleitet die Arbeit der Evangelischen Akademie zu Berlin und berät Leitung und Studienleitung bei der Programmentwicklung. Der Beirat hat bis zu zwanzig Mitglieder, die aus unterschiedlichen gesellschaftlichen Bereichen - Politik, Gesellschaft, Wirtschaft, Forschung, Kultur und Kirche - kommen. Sie werden von der Gesellschafterversammlung für jeweils fünf Jahre berufen. Die Leitung der zwei jährlichen Sitzungen liegt bei dem Vorsitzenden / der Vorsitzenden des Beirats.
Vorsitzende ist seit 2012 Marianne Birthler, die ehemalige Bundesbeauftragte für die Unterlagen des Staatssicherheitsdienstes der DDR.
